يقوم قسم الطفيليات الطبية بتدريس الأوليات والديدان المسببة للامراض والحشرات ذات الأهمية الطبية وطرق انتقال الطفيليات للانسان وتفاعلها مع البيئة بالاضافة الى طرق تشخيص الأمراض الطفيلية وطرق الوقاية منها.