انشأ قسم الفيزياء العامة بعد سودنة الجامعة وتم استيعاب  الطلاب به عام 1994م حيث تخرجت أول دفعة عام 1998م وكان يتحصل الطلاب على بكالوريوس الشرف نظام الأربعة سنوات في الفيزياء ، ومن ثم تم تحديث المناهج وأصبح هنالك تخصصات يمنحها قسم الفيزياء ، وتطورت كلية العلوم لتصبح كلية العلوم والتقانة وأصبح قسم الفيزياء أحد أقسام مدرسة الفيزياء والفيزياء التطبيقية .
  قسم الفيزياء يقوم بتدريس الفيزياء لكل الكليات العلمية . ويوجد به معملين ليغطي كل الجانب العملي لكورسات الفيزياء للفرقة الأولي لكل الكليات والأقسام العلمية بالجامعة ومعمل آخر لطلاب الفرق العليا بأقسام الفيزياء المختلفة، ومعمل تخصصي.
بقسم الفيزياء أفضل المعامل البحثية في السودان : لتحضير العينات وبعض القياسات الفيزيائية تحت ظروف فيزيائية مختلفة ، كما يوجد جهاز حيود الاشعة السينية الذى يخدم عدة أغراض بحثية.